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Dipende dagli urti e dalla loro forza, nonchè dalle condizioni al contorno. Nella vita di tutti i giorni gli urti fra gli atomi avvengono nell'aria e in tutti corpi gassosi, anche nei liquidi le molecole e gli atomi si urtano e scivolano fra loro continuamente senza trasformazioni significative nella loro forma e struttura. In ambienti particolari le cose cambiano. Nel nucleo delle stelle la pressione e la temperatura sono così elevate (10 000 000 °C) da permettere la fusione dei nuclei atomici da due atomi di idrogeno (H) si forma un atomo di elio (He) con liberazione di energia secondo la formula di Einstein: E = mc2 La fusione nucleare è la reazione che avviene nelle stelle e le mantiene in vita. Un altro tipo di scontro fra gli atomi avviene negli acceleratori di particelle come il CERN di Ginevra e il LNGS del Gran Sasso. Gli acceleratori di particelle, sfruttando dei magneti di dimensioni enormi, accelerano gli atomi a velocità elevatissime, li fanno scontrare...

La meccanica quantistica è una teoria, o meglio un insieme di teorie, che tentano di spiegare come funziona il mondo degli atomi e delle particelle subatomiche. La teoria è così complessa e paradossale che neppure gli autori la comprendevano in pieno. Per approfondire consiglio i seguenti link: meccanica quantistica - articolo meccanica quantistica - video

Le onde sonore sono perturbazioni delle molecole e degli atomi che compongono il mezzo di propagazione del suono (principalmente aria), senza le molecole e gli atomi il suono non si propaga, quindi non può propagarsi nel vuoto ( il suono ). Anche i batteri sono formati da atomi, come tutta la materia: gli atomi non sono isolati, ma collegati fra loro in strutture complesse chiamate molecole. ( cellula batterica ,  molecole organiche )

La forma degli atomi non è perfettamente nota, ma è determinata con calcoli matematici. Attualmente il modello atomico ufficiale è quello quantistico. L'atomo nell'interezza è considerato sferico, perchè è la forma che offre minor resistenza e la massima simmetria. Gli elettroni sono distribuiti su livelli energetici ben definiti, chiamati orbitali, Gli orbitali hanno forme semplici o complesse. Gli orbitali s  sono sferici (o meglio anulari), gli orbitali p sono a forma di otto tridimensionale, gli orbitali f , hanno forma di otto con un anello nella parte di congiunzione dei due lobi. Come detto all'inizio la forma degli orbitali è calcolata con metodi statistici, cioè si calcola la probabilità che un elettrone stia in una determinata zona geometrica. Non è possibile stabilire dove si trova un elettrone in un determinato momento (Principio di indeterminazione di Heisemberg). Al link seguente si trova la forma degli orbitali forma orbitali